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86年修正於私立學校法中取得法源依據,訂定「財團法人私立學校興學基金會組織及運作辦法」。
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88年12月奉行政院之核定。
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89年02月由教育部與財政部會銜發布。
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90年教育部於九十會計年度編列預算補助該基金會之部分捐助成立基金二千萬元並經由三大私立學校團體向私立學校募款各三五0萬,共同完成設立基金三千零伍拾萬元。
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91年03月研提「財團法人私立學校學基金會成立評估報告」,陳報行政院秘書長該基會設置之必要性。
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91年06月送件申請同意設立教育事務財團法人。
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91年08月教育部社教司以社(四)字第91119815號函同意設立許可。